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Dépistage du nouveau variant "Omicron"

La détection en Afrique du Sud d’un nouveau variant B1.1.529 nommé « Omicron » doit conduire les pharmaciens à la plus grande vigilance dans le cadre de leur rôle de dépistage du SARS-CoV-2.

A l’issue d’une réunion qui s’est tenue samedi 27 novembre en présence de l’Agence Régionale de Santé, l’Assurance Maladie et les URPS Pharmaciens et Biologistes, il a été arrêté la conduite à tenir suivante :
  • Interroger toute personne venant se faire tester sur un potentiel séjour à l’étranger dans les 14 jours précédant la date des symptômes ou du prélèvement, ou sur un potentiel contact à risque avec une personne y ayant séjourné. Cette mention fait l’objet d’un renseignement obligatoire de SIDEP (dans le champ « pays de provenance. »)
Cette interrogation pourra également être effectuée à l’occasion d’une demande de conseils pour des symptômes pouvant faire évoquer une infection virale.
 
  • Orienter vers la réalisation d’un test RT-PCR toute personne ayant séjourné dans les pays à risque[1] vis-à-vis du variant Omicron dans les 14 derniers jours ou ayant eu un contact à risque avec une personne y ayant séjourné et se présentant pour la réalisation d’un dépistage du SARS-CoV-2.
Dans ce dernier cas, n’effectuer un test antigénique qu’à la condition de pouvoir conjointement réaliser un prélèvement pour un test PCR, et ce quel que soit le résultat positif ou négatif du test antigénique (l’intérêt du test antigénique étant de déclencher plus rapidement le processus de contact-tracing par l’Assurance Maladie). Dans tous les cas, il est essentiel de s’assurer que le test RT-PCR puisse être pratiqué rapidement.   
 
L’URPS biologistes émet en parallèle une recommandation vers les laboratoires de biologie médicale afin que ceux-ci puissent fournir en kit de prélèvement PCR leurs partenaires (pharmacies, infirmiers, médecins, …), et renforcer les solutions de retour rapide au laboratoire pour la réalisation de la PCR.

Dans le cas où la pharmacie n’aurait pas déjà conventionné avec un laboratoire de biologie médicale, votre URPS Pharmaciens pourra vous transmettre un modèle de convention élaboré conjointement avec les 2 URPS.


 
A savoir : si un test RT-PCR positif nécessite un séquençage (cas des prélèvements à haut risque de mutant Omicron, ou criblage atypique), un délai de quelques jours sera nécessaire pour confirmer la nature du variant.
D’autre part, les contacts d’un patient « haut risque », y compris à jour de leur statut vaccinal, devront respecter les mesures classiques d’isolement.


[1] Afrique du Sud, Botswana, Eswatini, Lesotho, Mozambique, Namibie, Zimbabwe. Cette liste est susceptible d’évoluer rapidement dans les jours à venir.

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